Loginis atvejis. Dėl biologinės raidos pobūdžio ir kilmės

"Šansų logika. Biologinės evoliucijos pobūdis ir kilmė »

Copyright © 2012 pagal Pearson Education, Inc.

© vertimas, skelbimas rusų kalba, CJSC leidykla Namas CenterPoligrafas, 2014 m

© Dekoravimas, CJSC Leidyba Namas CenterPolygrafas, 2014 m


Visos teisės saugomos. Jokia šios knygos versijos dalis negali būti pakartota bet kokia forma ir bet kokiomis priemonėmis, įskaitant komandiravimą internete ir įmonių tinkluose, privataus ir viešojo naudojimo be raštiško autorių teisių turėtojo leidimo.


© Litų paruoštų knygos versija (www.litres.ru)

Autoriaus įvadas į rusų vertimą

Pranešimas, kad entuziastų grupė, savarankiškai organizuoti "LiveJournal", pradėjo dirbti su šios knygos vertimu, buvo už autorių visiškai nustebinti, žinoma, maloniai. XXI amžiuje, būtinybės versti mokslinę literatūrą iš anglų į bet kokias kitas kalbas klausimas, kad ji švelniai, yra dviprasmiškas. Moksliniai tekstai dabar skelbiami anglų kalba, o gebėjimas juos perskaityti šioje kalboje, yra pradinis profesionalaus tinkamumo reikalavimas. Mokslo ir populiari literatūra yra žinoma, visiškai kitokia. Ši knyga nėra populiari, bet ne tipinė specializuota monografija. Idealiu atveju šis tekstas skirtas plačiam skirtingų specialybių mokslininkų apskritimuose, įskaitant absolventų studentus ir vyresnius studentus. Žinoma, tai būtų puikiai, jei visa ši skaitytojo auditorija galėtų laisvai skaityti originalą, tačiau iki šiol mažai tikėtina, kad būsite realūs. Svarbiausias argumentas vertimui buvo tai, kad didelė vertėjų komanda susirinko dienomis. Esant tokiai situacijai, autorius apsvarstė savo patikimumą skaityti ir redaguoti visą tekstą vertimo, žinoma, po faktinio tikslumo.

Šios knygos originalas buvo paskelbtas 2011 m. Rudenį, dvejus metus iki Rusijos leidinio. Biologiniai tyrimai mūsų laike vyksta precedento neturinčiame tempe, o per metus, žinoma, daug svarbių naujų rezultatų ir daug rimtų straipsnių buvo paskelbta pagrindinėmis knygoje aptartų evoliucinės biologijos problemomis. Žinoma, autorius pasirodys nauji svarstymai, tik iš dalies paskelbti. Be to, daugelis skaitytojų, įskaitant vertėjus, ir pats autorius, redaguojant vertimą, pastebėjo netikslumus ir dviprasmiškumą pristatyme (tačiau jis yra žinomas autoriui, nė vienas iš jų negali būti laikomas rimta klaida). Visa tai buvo neįmanoma atsižvelgti į rusų vertimus, tačiau autorius bandė atspindėti svarbiausius paaiškinimus ir kai kurias įdomiausias mokslines naujienas į Rusijos leidinio pastabas. Tokios naujos pastabos pabaigoje pasirodė esąs daug daugiau nei tikėtasi darbo pradžioje redaguojant vertimą (ir gali būti dar daugiau - autorius išreiškė tik tada, kai jis negalėjo tylėti).

Autorius yra labai patenkintas, nes ji aiškiai iliustruoja šiuolaikinės evoliucinės biologijos pažangos greitį. Keletas pastabų yra labiau tikėtina, kad išversti, paaiškinant tas vietas tekste, kur anglų žaidimas. Žodžiai nepavyko tiksliai praeiti rusų kalba. Žinoma, šios pastabos negali teigti, kad knyga "antrasis leidimas", tai yra vertimas, tačiau autorius tikisi, kad šie maži papildymai padidintų jo vertę.

Autoriaus požiūriu pagrindinės knygos idėjos vis dar atlieka laiko bandymą (tegul astronominis skaičiavimas, bet nepaisoma, atsižvelgiant į ryškų kaupimosi lygį naujų duomenų); Bet kokiu atveju, reikia kažko radikaliai peržiūrėto dar kyla. Be to, autorius atrodo, kad praeities laikas sustiprino tik konceptualią informaciją apie organizmų ir jų genomų ir jų evoliucinių procesų įvairovę. Nauja evoliucinė sintezė, pagrįsta duomenimis iš genomikos ir sisteminės biologijos atrodo svarbus ir aktualus, kaip niekada anksčiau. Be tokio apibendrinimo, ji tampa tiesiog neįmanoma suvokti stebėjimų jūrą.

Žinoma, svarbu pabrėžti, kad ši knyga jokiu būdu negali reikalauti tokios naujos sintezės vaidmens. Tai tik eskizas, bandymas atspėti būsimo pastato kontūrus. Net ir paliekant pagrindinį mokslo atvirumą ir manydamas, kad kai kurie užbaigimo etapai ir apibendrinimas iš tikrųjų egzistuoja, pasak autoriaus, naujos evoliucinės biologijos sintezės užbaigimas yra ne mažiau kaip dviejų mokslo kartų atvejis. Per daug vis dar lieka neaišku, ir pernelyg daug reikia padaryti, kad būtų galima nustatyti milžiniškų duomenų masyvus, pagamintus genomikos ir sisteminės biologijos, atsižvelgiant į plonas ir pagrįstas teorijas ir sąvokas. Galbūt pagrindinis šios knygos uždavinys buvo nustatyti evoliucinės biologijos sritis, kur tradicinės idėjos neveikia, apibūdinkite galimus sprendimų būdus ir tik kai kuriais atvejais siūlome save sprendimus, žinoma, preliminariai. Kiek tai buvo valdoma, teisti skaitytojus.

Padėkos mokytojams, darbuotojams ir daugeliui kolegų, su kuriais buvo aptarta knygoje aptarta problema, pateikiami knygos pabaigoje. Čia autoriaus maloni pareiga yra išreikšti nuoširdžią dėka Gruzijai Jurevich Lubarsky už kolektyvinio vertimo ir jos organizavimo idėją, visi vertėjai ir redaktoriai leidyklos darbui rusų kalba ir asmeniškai vienas iš vertėjų, Valery Anisimovo, Dėl vertingų komentarų, daugiausia atsižvelgiama į autorių teisių raštu į vertimą.

Mano tėvams

ĮVADAS. \\ T Kelyje į naują evoliucinės biologijos sintezę 1
Vertimas apie šio įvedimo pavadinimo pristatė rimtų sunkumų. Anglų kalba buvo Postmoderninės sintezės link . Tai, žinoma, yra žodžių žaidimas: viena vertus, Postmodernus. reiškia tiesiog "po Šiuolaikinė sintezė "(Tai, kad rusų literatūroje paprastai vadinama sintetinė evoliucijos, STE) teorija, ir kita -" postmodernistas ". Kaip jį perkelti rusų kalba, visiškai neaišku. Blogiau, šis paprastas bausmė buvo pakartotinai grojama tolesniuose skyriuose. Nėra jokio būdo susidoroti su šia sunkumais, išskyrus šią pastabą, nei vertėjai, nei autorius nepamiršti (pranešimas. Auth. Į Rusijos leidinį čia ir tada kursyvu).

Šio darbo pavadinimas yra susijęs su keturiomis nuostabiomis knygomis: Ostero "muzikos bylos" grindų romanas (Auster, 1991), garsaus gydymo Jacques Mono molekulinė biologija, Evoliucija ir filosofija "atvejis ir būtinybė" (Monod, 1972), knyga Francois Jacob "loginis gyvenimas" (Jokūbas, 1993) ir, žinoma, "rūšies" kilmė "Charles Darvinas (Darvinas, 1859). Kiekviena iš šių knygų paveikia vieną ir tą pačią įtraukią temą: savavališkumo ir tvarkos santykis, galimybė ir būtinybė gyvenime ir evoliucijai.

Tik po to, kai šis darbas buvo baigtas ir jau buvo paskutiniame redagavimo etape, pripažinau John Venna knygą, išskirtinę logiką ir Filosofą nuo Kembridžo, kuris 1866 m. Paskelbė darbo "Case Logika: esė apie tikimybės pagrindus ir struktūrą teorija "(1866 m.). Šiame darbe "Venn" pristato tikimybės dažnio aiškinimą, kuris išlieka tikimybės ir statistikos teorijos pagrindu iki šios dienos. Dauguma visų John Venn yra žinoma, natūraliai, "Omnipresent" diagramos, išradstamos išrastos. Aš supainiojau dėl to, kad aš nežinojau apie venna darbą, kai pradėjau šią knygą. Kita vertus, man sunku įsivaizduoti vertingesnį pirmtaką.

Pagrindinis impulsas rašyti šią knygą buvo mano įsitikinimas, kad dabar, praėjus 150 metų po Darvino ir 40 metų po Mono, mes surinkome pakankamai duomenų ir idėjų plėtoti gilesnį ir tikriausiai labiau patenkinamą aiškinimą iš esmės svarbių santykių tarp bylos ir būtinumo. Mano pagrindinis darbas yra tai, kad nelaimingas atsitikimas riboja įvairiais veiksniais yra visos gyvenimo istorijos pagrindu.

Daugelis įvykių siekė dirbti šioje autoriaus knygoje. Tiesioginė paskata siekiant apibūdinti naują išvaizdą į evoliuciją, buvo genomų tyrimo revoliucija, kuri prasidėjo pastaraisiais XX amžiaus dešimtmečiu ir tęsiasi iki šios dienos. Gebėjimas palyginti nukleotidų seką tūkstančių organizmų įvairių rūšių kokybiškai pakeitė visų evoliucinės biologijos kraštovaizdį. Mūsų išvados apie išnykimą, protėvių gyvenimo formos nebėra neaiškūs atspėti, kad jie buvo anksčiau (bent jau organizmams, kurių fosilijos nebuvo atrasta). Genomų palyginimas atskleidžia įvairius genų, saugomų pagrindinėse gyvenamųjų būtybių grupėse (kai kuriais atvejais net ir visose ar daugelyje jų), ir tokiu būdu atneša mums neįsivaizduojamais anksčiau patikima informacija apie protėvių formas. Pavyzdžiui, tai nebus perdėta deklaruoti, kad mes turime gana visišką supratimą apie pagrindinę genetinę sudėtį paskutinio bendrojo protėvio visų bakterijų, kuri tikriausiai gyveno apie 3,5 milijardų metų. Daugiau seniausių protėvių matoma mažiau aiškiai, tačiau tam tikros funkcijos yra iššifruotos net ir jiems. Genominė revoliucija ne tik leidžia pasitikėti senovės gyvenimo formų genų rinkinių rekonstrukcija. Dar svarbiau yra tai, kad jis tiesiog pavertė centrinę evoliucinės biologijos metaforą (ir galbūt visą biologiją) - gyvenimo medį (j), rodančiu, kad atskirų genų evoliucinės trajektorijos yra nesuderinamos skirtingos. Klausimas, susijęs su tuo, ar J yra atgimęs ir jei taip, kokia forma, ji išlieka griežtų ginčų, kurie yra viena iš svarbiausių šios knygos temų.

Manau, JA rudenį kaip "meta atskyrimo", didžiausias pokytis visos koncepcinės struktūros biologijos. Akivaizdžiai rizikuoja sukelti daugeliui pykčio dėl sąlyčio su kenkėjiška kultūringa tendencija, vis dėlto raginu šį pagrindinį pakeitimą pereinant prie postmoderninio biologinio požiūrio į gyvenimą 2
Daugeliu atvejų šios idėjos grindžiamos didžiausio šiuolaikinio "Ford Dulitla" evoliucionieriaus paskelbimu, kuris cituojamas atitinkamuose skyriuose.

Iš esmės šis perėjimas atveria evoliucijos modelių ir procesų įvairovę, centrinį nenuspėjamų įvykių vaidmenį gyvenimo formų evoliucijoje ["evoliucija kaip" Haltura "(evoliucija kaip Tinkering)] ir, ypač panadapotializmo žlugimą Evoliucinės biologijos paradigma. Nepaisant to, kad Darvino susižavėjimas privalo padaryti Viktorijos požiūrį į pasaulį (įskaitant atnaujintus versijas, kurios klestinčios XX a.) Į gerbiamų muziejų salėse, kur vieta yra vieta, ir ištirti paradigmos keitimo pasekmes .

Šis perversmas evoliucinėje biologijoje turi kitą planą. Lyginamoji genomika ir evoliucinė sisteminė biologija (pavyzdžiui, lyginamasis tyrimo genų ekspresijos, baltymų koncentracijos ir kitų molekulinės charakteristikų fenotipo) atskleidė keletą bendrų modelių, kurie rodomi visose ląstelių gyvenimo formų iš bakterijų į žinduolius. Tokių visuotinių modelių egzistavimas rodo, kad santykinai paprasti molekuliniai modeliai, panašūs į statistinėje fizikoje naudojamus molekulinius modelius, gali paaiškinti svarbius biologinės raidos aspektus; Kai kurie panašūs modeliai, turintys didelę nuspėjamąją jėgą. Žinomo "pavydai fizikams", kuri, atrodo, nerimauja dėl daugelio biologų (įskaitant mane), gali būti užgesintas naujausiais ir artėjančiais teoriniais tyrimais. Papildomi ryšiai tarp bendrų tendencijų ir nenuspėjamumo konkrečių evoliucijos rezultatų yra pagrindinis biologinės raidos ir dabartinės revoliucijos evoliucinėje biologijoje - ir tai yra dar viena svarbi šios knygos tema.

Kita priežastis, dėl kurios atsiranda naujos sintetinės aplinkybės išvaizda evoliucinė teorijakuri yra siūloma šioje knygoje, tam tikru mastu asmeniškai. aš turiu aukštasis išsilavinimas ir baigė magistrantūros mokyklą Maskvoje valstijos universitetas (Net per TSRS), molekulinės virusologijos srityje. Mano kandidatas į darbą įtraukė eksperimentinį poliviruso ir susijusių virusų reprodukcijos tyrimą, mažą geną, kurį sudaro RNR molekulė. Aš niekada nežinojau, kaip dirbti su savo rankomis, o vieta ir laikas buvo ne geriausi eksperimentams, nes net paprasčiausias reagentus buvo sunku gauti. Nedelsiant mano kandidato pabaigoje, mano kolega, Aleksandras Evgenievich Gorbalene, pradėjo eiti į kitą mokslinių tyrimų kryptį, kuri tuo metu atrodė daug visiškai nežinomų. Tai buvo "pažvelgti į sekas" - bando prognozuoti baltymų, koduotų mažame genomo virusų funkciją (tai buvo vieninteliai pilni genomai tuo metu), remiantis jų aminorūgščių plytų seka. Šiandien kiekvienas gali lengvai atlikti tokią analizę naudojant patogią programinę įrangą, kurią galite atsisiųsti nemokamai nuo interneto; Natūralu, prasmingas rezultato aiškinimas vis tiek reikalauja mąstymo ir įgūdžių (čia nieko nepasikeitė. Tačiau 1985 m. Buvo praktiškai nėra kompiuterių ar programų. Ir dar, su mūsų programuotojų pagalba, mums pavyko sukurti keletą gana naudingų programų (mes įstrigo juos ant balandžių). Liūto dalis analizės buvo atlikta rankiniu būdu (arba tiksliau, į akis). Priešingai visiems sunkumams ir nepaisant kai kurių praleistų galimybių, mūsų pastangos per ateinančius penkerius metus buvo gana sėkmingos. Mes galėjome pasukti funkcinius žemėlapius labiausiai mažų genomų nuo daugelio neištirtų teritorijų labai turtingų genominių kortelių biologinių funkcijų. Dauguma prognozes vėliau buvo patvirtinta patirtimi, nors kai kurie iš jų vis dar dirba: laboratoriniai eksperimentai užima daug daugiau laiko nei kompiuterių analizė. Esu įsitikinęs, kad mūsų sėkmė buvo ankstyvas supratimas apie labai paprastą, bet stebėtinai galingą pagrindinį evoliucinės biologijos principą: jei akivaizdžiai išskiriamas baltymų seka lieka ilgai evoliucijai, tai yra funkcionaliai svarbi ir konservatyvesnė, tai yra funkcionaliai svarbi ir konservatyvesnė svarbesnė funkcija. Šis principas, iš esmės, atsirandantis dėl paprasto sveiko proto, bet, žinoma, griežtai sekus nuo molekulinės evoliucinės teorijos, puikiai įteikė savo tikslus, ir aš esu įsitikinęs, kad prieš mano dienas aš padariau mane evoliuciniu biologu. Aš linkiu pakartoti gerai žinomą sakydamas apie didžiųjų evoliucinių genetiką Feodosia Bluansky: "Nieko biologijos prasminga, išskyrus evoliucijos pasaulyje" (Dobzhansky, 1973) - dar tiesiog tiesiogiai: biologija yra evoliucija.

Tomis ankstyvomis evoliucinių genomikos dienomis Sasha dažnai kalbėjo apie galimybę, kad mūsų mėgstamiausia RNR virusai yra tiesioginiai seniausių gyvenimo formų palikuonys. Galų gale tai yra mažos ir paprastos genetinės sistemos, naudojant tik vieną nukleino rūgšties tipą, o jų replikacija yra tiesiogiai susijusi su išraiška per genomo RNR perdavimą. Žinoma, tai buvo vakaro pokalbiai, ne visi susiję su mūsų kasdieniniais bandymais atrinkti funkcines virusinių baltymų funkcijas. Šiandien, praėjus 25 metams, kai buvo tiriami šimtai įvairių virusų ir savininkų genomų, kokių virusų (ar panašių į virusų genetinius elementus) idėja gali būti pagrindinė ankstyvosiose gyvenimo raidos etapuose, nuo rūko prielaidų padidėjo koncepcija, suderinama su didžiuliu didžiuliais eksperimentiniais duomenimis. Mano nuomone, tai yra perspektyviausia refleksijos ir analizės linija ankstyvųjų gyvenimo raidos etapų tyrimuose.

Tai yra įvairios konceptualios linijos, kurios netikėtai susirinko didėjant realizavimui, kad mūsų supratimas apie evoliuciją ir su juo ir biologijos prigimtį amžinai persikėlė nuo 20-ojo amžiaus vyraujančių nuomonių, kurie šiandien atrodo labiau linkę ir greičiau dogmatinis. Tam tikru momentu noras išvengti šių linijų prijungto vaizdo panašumu buvo neįveikiama, o ši knyga pasirodė iš čia.

Kai kurios paskatos rašyti šią knygą nebuvo nuo biologijos, bet nuo ryškių šiuolaikinės kosmologijos pasiekimų. Šie atradimai ne tik iškėlė kosmologiją į tikros fizikos lygį, bet ir visiškai pasuko mūsų idėjas apie pasaulį, ypač apie atsitiktinumo ir būtinumo pobūdį. Kai kalbama apie biologijos sienas, pvz., Gyvenimo kilmės problemą, ši nauja pažvelgti į pasaulį neįmanoma atsižvelgti. Fizika ir kosmologai vis labiau nustatė klausimą, kodėl pasaulyje yra kažkas, o ne nieko, ne tik kaip filosofinis, bet ir kaip fizinė problema, ir ištirti galimus atsakymus tam tikrų fizinių modelių pavidalu. Sunku ne užduoti to paties klausimo apie biologinį pasaulį ir daugiau nei vieną lygį: kodėl yra gyvenimas, o ne tik jonų ir mažų molekulių sprendimai? Ir jei gyvenimas egzistuoja, kodėl yra palmių ir drugelių, katės ir šikšnosparniai, o ne tik bakterijos? Esu tikras, kad šie klausimai gali būti pristatytas tiesioginio moksliškai, ir man atrodo, kad jau yra tikėtini, nors ir preliminarūs, atsakymai.

Naujausi pasiekimai didelės energijos fizikos ir kosmologijos fizikos buvo įkvėpimo šios knygos ne tik tiesioginės mokslinės prasme. Daugelis pirmaujančių teorinių fizikos ir kosmologų pasirodė esančių talentingų populiarių ir populiarių mokslo knygų rašytojai (kurie galvoja apie ryšį tarp abstrakčių mąstymo aukščiausias lygis Ir literatūros talentas), kuris perduoda emocinį kėlimą, kylantį su naujausiais visatos struktūros atradimais, nuostabiu aiškumu, malone ir "Fervo". Šiuolaikinė tokios literatūros banga sutampa su kosmologijos revoliucija prasidėjo su klasikiniu " Trumpa istorija Laikas "Stephen Hawking (Hawking, 1988). Nuo tada atsirado dešimtys skirtingų nuostabių knygų. Vienas iš jų, stipresnis už kitus, pakeitė savo nuomonę apie pasaulį, yra nuostabi trumpoji "Aleksandro vilenkin" knyga "daugelio pasaulio pasaulis" (Vilenkin, 2007), bet Stephen Weinbergo (Weinberg, 1994), Alan Guth (Guth, buvo vienodai svarbūs. 1998a), Leonardo Zyuskovinda (SUSSKIND, 2006B), SEAN CARROLL (CARROLL, 2010) ir Lee Smolina (ginčijama knygoje apie "kosminės gamtos pasirinkimą"; SMOLIN, 2010). Šios knygos yra daug daugiau nei tik puikus populiarinimas: kiekvienas iš jų bando pateikti prijungtą, bendrą vaizdą tiek pagrindinio pasaulio pobūdžio ir mokslo, kuris jį tiria. Kiekvienas iš šių pasaulio paveikslų yra unikalus, tačiau daugeliu aspektų jie eina šalia ir papildo vienas kitą. Kiekvienas iš jų grindžiamas griežtu mokslu, bet taip pat yra ekstrapoliavimo ir prielaidų elementai, plati apibendrinimai ir, be abejo, prieštaravimai. Kuo daugiau perskaičiau šias knygas ir svarstydamas apie naujų pasaulėžiūrą, tuo stipresniu norėjau daryti kažką panašaus savo srityje, molekulinė biologija. Tam tikru momentu, skaitant Vilenkin knygą, supratau, kad galbūt yra tiesioginis ir iš esmės svarbus ryšys tarp naujų nuomonių dėl šiuolaikinės kosmologijos tikimybės ir bylos ir gyvenimo kilmės - arba biologinio kilmės evoliucija. Didelis renginio vaidmuo gyvenime žemėje, esant šioje svarstymų eilutėje, yra neabejotinai ypatinga ir tikrai nuliūdins daug, bet manau, kad jis negalėjo būti paliktas be dėmesio, jei norime rimtai kreiptis į šią problemą gyvenimo kilmės.

Ši knyga yra mano požiūris į dabartinę evoliucinės biologijos būklę lyginamosios genomikos ir sisteminės biologijos požiūriu; Todėl neišvengiamai apima ne tik nustatytus faktus ir patvirtino teorinius modelius, bet ir atspėti ir prielaidas. Šioje knygoje bandau laikyti sieną tarp faktų ir taip aiškiai atspėti. Norėjau parašyti knygą pirmiau minėtų puikių mokslo ir populiarių knygų fizikos stiliaus, tačiau pristatymas buvo skirtas ir atsisakyta rašyti tokiu būdu. Kaip rezultatas, tekstas pasirodė esąs daug mokslo, nei galvojo iš pradžių, nors tai dažniausiai nėra taip pat specializuojasi ir apibūdina gana kai kuriuos metodus, be to, labai supaprastinta. Vienas svarbus rezervavimas: Nors knyga yra skirta įvairiems evoliucijos aspektams, ji tebėra pasirinktų temų skyrių kolekcija ir jokiu būdu nesikreipia į integracinį darbą. Daug svarbių ir populiarių temų, tokių kaip daugialypių organizmų kilmė arba gyvūnų vystymosi raida, nėra visiškai sąmoningai paveiktos. Kiek įmanoma, bandžiau laikytis knygos LeitMotif: Sąveika tarp bylos ir tvarkingų procesų. Kitas subtilus momentas yra susijęs su nuoroda į literatūrą: pabandykite įjungti, ne visi, bet bent pagrindiniai šaltiniai, bibliografija būtų daug tūkstančių nuorodų. Aš atsisakiau bandyti tai padaryti nuo pat pradžių, taigi ir nuorodas į knygos pabaigoje sąrašą yra tik nedidelis mėginys, susijęs su darbo tema, ir jų pasirinkimas yra iš dalies subjektyvus. Aš nuoširdžiai atsiprašau kolegoms, kurių svarbus darbas išliko nematytas.

Nepaisant visų šių įspėjimų, tikiuosi, kad čia pateikti apibendrinimai ir idėjos bus įdomios daugeliui mano kolegų mokslininkų ir studentų - ne tik biologai, bet ir fizikai, chemikai, geologai ir visi suinteresuoti gyvenimo raida ir kilmę.

Kita priežastis dėl naujos sintetinės evoliucinės teorijos, kuri siūloma šioje knygoje, išvaizda, tam tikru mastu asmeniškai. Gavau aukštąjį mokslą ir baigiau Maskvos valstybinio universiteto absolventų mokyklą (net per TSRS), molekulinės virologijos srityje. Mano kandidatas į darbą įtraukė eksperimentinį poliviruso ir susijusių virusų reprodukcijos tyrimą, mažą geną, kurį sudaro RNR molekulė. Aš niekada nežinojau, kaip dirbti su savo rankomis, o vieta ir laikas buvo ne geriausi eksperimentams, nes net paprasčiausias reagentus buvo sunku gauti. Nedelsiant mano kandidato pabaigoje, mano kolega, Aleksandras Evgenievich Gorbalene, pradėjo eiti į kitą mokslinių tyrimų kryptį, kuri tuo metu atrodė daug visiškai nežinomų. Tai buvo "pažvelgti į sekas" - bando prognozuoti baltymų, koduotų mažame genomo virusų funkciją (tai buvo vieninteliai pilni genomai tuo metu), remiantis jų aminorūgščių plytų seka. Šiandien kiekvienas gali lengvai atlikti tokią analizę naudojant patogią programinę įrangą, kurią galite atsisiųsti nemokamai nuo interneto; Natūralu, prasmingas rezultato aiškinimas vis tiek reikalauja mąstymo ir įgūdžių (čia nieko nepasikeitė. Tačiau 1985 m. Buvo praktiškai nėra kompiuterių ar programų. Ir dar, su mūsų programuotojų pagalba, mums pavyko sukurti keletą gana naudingų programų (mes įstrigo juos ant balandžių). Liūto dalis analizės buvo atlikta rankiniu būdu (arba tiksliau, į akis). Priešingai visiems sunkumams ir nepaisant kai kurių praleistų galimybių, mūsų pastangos per ateinančius penkerius metus buvo gana sėkmingos. Mes galėjome pasukti funkcinius žemėlapius labiausiai mažų genomų nuo daugelio neištirtų teritorijų labai turtingų genominių kortelių biologinių funkcijų. Dauguma prognozes vėliau buvo patvirtinta patirtimi, nors kai kurie iš jų vis dar dirba: laboratoriniai eksperimentai užima daug daugiau laiko nei kompiuterių analizė. Esu įsitikinęs, kad mūsų sėkmė buvo ankstyvas supratimas apie labai paprastą, bet stebėtinai galingą pagrindinį evoliucinės biologijos principą: jei akivaizdžiai išskiriamas baltymų seka lieka ilgai evoliucijai, tai yra funkcionaliai svarbi ir konservatyvesnė, tai yra funkcionaliai svarbi ir konservatyvesnė svarbesnė funkcija. Šis principas, iš esmės, atsirandantis dėl paprasto sveiko proto, bet, žinoma, griežtai sekus nuo molekulinės evoliucinės teorijos, puikiai įteikė savo tikslus, ir aš esu įsitikinęs, kad prieš mano dienas aš padariau mane evoliuciniu biologu. Aš linkiu pakartoti gerai žinomą sakydamas apie didžiųjų evoliucinių genetiką Feodosia Bluansky: "Nieko biologijos prasminga, išskyrus evoliucijos pasaulyje" (Dobzhansky, 1973) - dar tiesiog tiesiogiai: biologija yra evoliucija.


Vėl perskaitykite. Kai autorius maloniai atsiuntė man dar nepaskelbta angliška versija. Ir dabar Jekaterinburgas nusipirko Rusijos leidimą knygyne ( organizuotas ir P) Ir skaityti su dideliu malonumu. Beje. eugene_koonin. Į pratimą reikia rūpintis kruopštu klausimu: kodėl jums reikia Rusijos leidinio apskritai, jei mokslo kalba yra anglų kalba? Na, čia, pavyzdžiui, rusų skaityti tokius tekstus daug lengviau, todėl.

Rezervavimas, kad aš nesu specialistas ir tt, yra netinkami - natūraliai, tai yra mano žurnalas, ir aš išreiškiu savo asmeninę nuomonę, bet tai, ką suprantu / nesuprantu, kas skaitytojai (bet kuriuo atveju, nuolatiniai skaitytojai) tarp savo, savo ruožtu, nuomone.

Knyga yra neabejotinai išskirtinė. Retai, kas populiari knyga (žinoma, "populiarus" jis yra labai sąlyginis) skaityti su tokiu malonumu ir su tokia nauda. Du dalykai buvo atidėti kaip idealiai svarbūs.

1. Suprasti sudėtingumą kaip šiek tiek pramoninio chaoso. Tai konstruktyviai pasirodė, kad jis jau buvo aptartas su darbuotoju visiškai konkrečiais skaičiavimais, kuriuos reikia atlikti grynai fizine proga. Bet ne tik. Apskritai tai yra apie neutralią raidą, apie beprasmišką, dažniausiai genomą, apie evoliuciją kaip meistras, kuris trunka su esamu mechanizmu ratais ir nesukuria visko naujo ir tobulo - labai, labai svarbus manęs. Net ir labai ankstyvame jaunystėje atsitiktinės apleistos Lem pastabos buvo pažymėtos (ypač "Viešpaties Glyov") dėl nelaimingų atsitikimų vaidmens evoliucijoje, ir tada jie jau sukūrė gilų įspūdį. Bet tada visa knyga, argumentai, paaiškinimai, viskas.

2. biologinės pažangos sąvokos prasmė, \\ t antisudėtingumo (organisman) ir tinkamumo koreliacija. Labiausiai evoliuciškai sėkmingi būtybės yra paprastos, optimalios, genome, jie turi visus du kartus, kaip ir "rankiniu būdu instrukcija", tiesiogiai veiksmingų kai kurių vadovų. Ir mes esame beprotiški, kurie nėra pasirinkę tik dėl mūsų nedidelio skaičiaus. Taip, taip, tai yra apie viešąjį įrenginį (kokiomis asociacijomis autorius, žinoma, nėra kaltinamas, tai yra išmatuoti savo korupciją).

Nuvalykite kruopščiai smegenis apie Darvinas, LaKarka, STA ir kitus dalykus, kurie ankstesni Rabinovich (bloga prasme) buvo įdėti.

Dabar ... Oi. Taip, taip, apie paskutinius skyrius apie antropinį principą, multivarą ir infliaciją. Aš perskaičiau šiuos skyrius ir mielai džiaugiuosi, kad tai buvo ne biologas. Tai, ką turiu, pagal Didžiojo Larkino žodį, o ne "scenarijus" ir skaičiavimus ir rezultatus (taip pat visiškai konkrečių eksperimentų paaiškinimus ir prognozes). Staiga suprato, kad molekulinė biologija (ir evoliucinė biologija, nors aš suprantu, būdinga biologija, pasak autoriaus, tiesiog neįvyksta) yra labai panašus į mūsų "pagrindinę fiziką". Čia, kvantinė lauko teorija, sunkumas, kosmologija, tai viskas. Ir mano sutrumpinta būsena, su tiesiu siekiais suprasti aplink mus - analogas klasikinės lauko biologijos, visa tai zoologija-Nerds. Ir tai yra visiškai kitokia psichologija mokslo kūrybiškumas, Skirtinga motyvacija. Jei buvau biologas, aš norėčiau ištirti tam tikrą žuvų elgesį (ten buvo tokia grupė Leiden, jie atrodė, kad jie buvo užblokuoti dėl blogų formalių rodiklių, palyginti su MilCaris). Ir visiškai natūralu, kad "pasaulinių" biologų fizika yra pritraukta ne su sutrumpintos valstybės fizika, kuri, atrodo, yra arčiau jų ištirtų objektų pobūdį, nes Schrödinger sakė - aperiodinis kristalas? - Tada tai yra mums ir kvantinė kosmologija. Kaip yra Mayakovsky? "Valstybė yra dideliuose dalykuose. Domina - visų rūšių perdavimai, tada ... laiko mašina."

Ir kiek mes, fizikai, džiaugiamės, kad sutrumpinta būsena yra daugiau nei pusė visų fizikos, kad stygos nesiėmė mūsų po cokolių, kaip molekulinės biologai lauko, kad vyras į Izozeno mūšį, ką kiemas rūpinasi tuo ... PAH, kur taip, ten ten atnešė.

Na, aišku, kad branduolinė fizika buvo Daug svarbiau nei kiti. Iki šiol paaiškėjo, kad tranzistoriai ir lazeriai išrado be triukšmo ir siurblių yra daug svarbesni už atomines bombas, jau nekalbant apie "Colliders". Tai buvo viskas. Ir praėjo. Tai taip pat praeis.

Evgeny Kunin.

Loginis atvejis. Dėl biologinės raidos pobūdžio ir kilmės

"Šansų logika. Biologinės evoliucijos pobūdis ir kilmė »

Copyright © 2012 pagal Pearson Education, Inc.

© vertimas, skelbimas rusų kalba, CJSC leidykla Namas CenterPoligrafas, 2014 m

© Dekoravimas, CJSC Leidyba Namas CenterPolygrafas, 2014 m

Visos teisės saugomos. Jokia šios knygos versijos dalis negali būti pakartota bet kokia forma ir bet kokiomis priemonėmis, įskaitant komandiravimą internete ir įmonių tinkluose, privataus ir viešojo naudojimo be raštiško autorių teisių turėtojo leidimo.

© Litų paruoštos knygos versija

Pranešimas, kad entuziastų grupė, savarankiškai organizuoti "LiveJournal", pradėjo dirbti su šios knygos vertimu, buvo už autorių visiškai nustebinti, žinoma, maloniai. XXI amžiuje, būtinybės versti mokslinę literatūrą iš anglų į bet kokias kitas kalbas klausimas, kad ji švelniai, yra dviprasmiškas. Moksliniai tekstai dabar skelbiami anglų kalba, o gebėjimas juos perskaityti šioje kalboje, yra pradinis profesionalaus tinkamumo reikalavimas. Mokslo ir populiari literatūra yra žinoma, visiškai kitokia. Ši knyga nėra populiari, bet ne tipinė specializuota monografija. Idealiu atveju šis tekstas skirtas plačiam skirtingų specialybių mokslininkų apskritimuose, įskaitant absolventų studentus ir vyresnius studentus. Žinoma, tai būtų puikiai, jei visa ši skaitytojo auditorija galėtų laisvai skaityti originalą, tačiau iki šiol mažai tikėtina, kad būsite realūs. Svarbiausias argumentas vertimui buvo tai, kad didelė vertėjų komanda susirinko dienomis. Esant tokiai situacijai, autorius apsvarstė savo patikimumą skaityti ir redaguoti visą tekstą vertimo, žinoma, po faktinio tikslumo.

Šios knygos originalas buvo paskelbtas 2011 m. Rudenį, dvejus metus iki Rusijos leidinio. Biologiniai tyrimai mūsų laike vyksta precedento neturinčiame tempe, o per metus, žinoma, daug svarbių naujų rezultatų ir daug rimtų straipsnių buvo paskelbta pagrindinėmis knygoje aptartų evoliucinės biologijos problemomis. Žinoma, autorius pasirodys nauji svarstymai, tik iš dalies paskelbti. Be to, daugelis skaitytojų, įskaitant vertėjus, ir pats autorius, redaguojant vertimą, pastebėjo netikslumus ir dviprasmiškumą pristatyme (tačiau jis yra žinomas autoriui, nė vienas iš jų negali būti laikomas rimta klaida). Visa tai buvo neįmanoma atsižvelgti į rusų vertimus, tačiau autorius bandė atspindėti svarbiausius paaiškinimus ir kai kurias įdomiausias mokslines naujienas į Rusijos leidinio pastabas. Tokios naujos pastabos pabaigoje pasirodė esąs daug daugiau nei tikėtasi darbo pradžioje redaguojant vertimą (ir gali būti dar daugiau - autorius išreiškė tik tada, kai jis negalėjo tylėti). Autorius yra labai patenkintas, nes ji aiškiai iliustruoja šiuolaikinės evoliucinės biologijos pažangos greitį. Keletas pastabų yra labiau tikėtina perkelti, paaiškinti tuos vietas tekste, kur anglų kalbos žodžių žaidimas nepavyko tiksliai praeiti rusų kalba. Žinoma, šios pastabos negali teigti, kad knyga "antrasis leidimas", tai yra vertimas, tačiau autorius tikisi, kad šie maži papildymai padidintų jo vertę.

Autoriaus požiūriu pagrindinės knygos idėjos vis dar atlieka laiko bandymą (tegul astronominis skaičiavimas, bet nepaisoma, atsižvelgiant į ryškų kaupimosi lygį naujų duomenų); Bet kokiu atveju, reikia kažko radikaliai peržiūrėto dar kyla. Be to, autorius atrodo, kad praeities laikas sustiprino tik konceptualią informaciją apie organizmų ir jų genomų ir jų evoliucinių procesų įvairovę. Nauja evoliucinė sintezė, pagrįsta duomenimis iš genomikos ir sisteminės biologijos atrodo svarbus ir aktualus, kaip niekada anksčiau. Be tokio apibendrinimo, ji tampa tiesiog neįmanoma suvokti stebėjimų jūrą.

Žinoma, svarbu pabrėžti, kad ši knyga jokiu būdu negali reikalauti tokios naujos sintezės vaidmens. Tai tik eskizas, bandymas atspėti būsimo pastato kontūrus. Net ir paliekant pagrindinį mokslo atvirumą ir manydamas, kad kai kurie užbaigimo etapai ir apibendrinimas iš tikrųjų egzistuoja, pasak autoriaus, naujos evoliucinės biologijos sintezės užbaigimas yra ne mažiau kaip dviejų mokslo kartų atvejis. Per daug vis dar lieka neaišku, ir pernelyg daug reikia padaryti, kad būtų galima nustatyti milžiniškų duomenų masyvus, pagamintus genomikos ir sisteminės biologijos, atsižvelgiant į plonas ir pagrįstas teorijas ir sąvokas. Galbūt pagrindinis šios knygos uždavinys buvo nustatyti evoliucinės biologijos sritis, kur tradicinės idėjos neveikia, apibūdinkite galimus sprendimų būdus ir tik kai kuriais atvejais siūlome save sprendimus, žinoma, preliminariai. Kiek tai buvo valdoma, teisti skaitytojus.

Padėkos mokytojams, darbuotojams ir daugeliui kolegų, su kuriais buvo aptarta knygoje aptarta problema, pateikiami knygos pabaigoje. Čia autoriaus maloni pareiga yra išreikšti nuoširdžią dėka Gruzijai Jurevich Lubarsky už kolektyvinio vertimo ir jos organizavimo idėją, visi vertėjai ir redaktoriai leidyklos darbui rusų kalba ir asmeniškai vienas iš vertėjų, Valery Anisimovo, Dėl vertingų komentarų, daugiausia atsižvelgiama į autorių teisių raštu į vertimą.

Mano tėvams

ĮVADAS. \\ T Kelyje į naują evoliucinės biologijos sintezę

Šio darbo pavadinimas yra susijęs su keturiomis nuostabiomis knygomis: grindų Ostero "muzikos bylos" romanas (Auster, 1991), garsaus "Thaka Mongo" traktuoja molekulinės biologijos, evoliucijos ir filosofijos "bylos ir būtinumo" (Monod, 1972), Francois Jacob "Life Logic" knyga (Jokūbas, 1993) ir, žinoma, "rūšių kilmė" Charles Darvinas (Darvinas, 1859). Kiekviena iš šių knygų paveikia vieną ir tą pačią įtraukią temą: savavališkumo ir tvarkos santykis, galimybė ir būtinybė gyvenime ir evoliucijai.

Tik po to, kai šis darbas buvo baigtas ir jau buvo paskutiniame redagavimo etape, pripažinau John Venna knygą, išskirtinę logiką ir Filosofą nuo Kembridžo, kuris 1866 m. Paskelbė darbo "Case Logika: esė apie tikimybės pagrindus ir struktūrą teorija "(1866 m.). Šiame darbe "Venn" pristato tikimybės dažnio aiškinimą, kuris išlieka tikimybės ir statistikos teorijos pagrindu iki šios dienos. Dauguma visų John Venn yra žinoma, natūraliai, "Omnipresent" diagramos, išradstamos išrastos. Aš supainiojau dėl to, kad aš nežinojau apie venna darbą, kai pradėjau šią knygą. Kita vertus, man sunku įsivaizduoti vertingesnį pirmtaką.

Pagrindinis impulsas rašyti šią knygą buvo mano įsitikinimas, kad dabar, praėjus 150 metų po Darvino ir 40 metų po Mono, mes surinkome pakankamai duomenų ir idėjų plėtoti gilesnį ir tikriausiai labiau patenkinamą aiškinimą iš esmės svarbių santykių tarp bylos ir būtinumo. Mano pagrindinis darbas yra tai, kad nelaimingas atsitikimas riboja įvairiais veiksniais yra visos gyvenimo istorijos pagrindu.

Daugelis įvykių siekė dirbti šioje autoriaus knygoje. Tiesioginė paskata siekiant apibūdinti naują išvaizdą į evoliuciją, buvo genomų tyrimo revoliucija, kuri prasidėjo pastaraisiais XX amžiaus dešimtmečiu ir tęsiasi iki šios dienos. Gebėjimas palyginti nukleotidų seką tūkstančių organizmų įvairių rūšių kokybiškai pakeitė visų evoliucinės biologijos kraštovaizdį. Mūsų išvados apie išnykimą, protėvių gyvenimo formos nebėra neaiškūs atspėti, kad jie buvo anksčiau (bent jau organizmams, kurių fosilijos nebuvo atrasta). Genomų palyginimas atskleidžia įvairius genų, saugomų pagrindinėse gyvenamųjų būtybių grupėse (kai kuriais atvejais net ir visose ar daugelyje jų), ir tokiu būdu atneša mums neįsivaizduojamais anksčiau patikima informacija apie protėvių formas. Pavyzdžiui, tai nebus perdėta deklaruoti, kad mes turime gana visišką supratimą apie pagrindinę genetinę sudėtį paskutinio bendrojo protėvio visų bakterijų, kuri tikriausiai gyveno apie 3,5 milijardų metų. Daugiau seniausių protėvių matoma mažiau aiškiai, tačiau tam tikros funkcijos yra iššifruotos net ir jiems. Genominė revoliucija ne tik leidžia pasitikėti senovės gyvenimo formų genų rinkinių rekonstrukcija. Dar svarbiau yra tai, kad jis tiesiog pavertė centrinę evoliucinės biologijos metaforą (ir galbūt visą biologiją) - gyvenimo medį (j), rodančiu, kad atskirų genų evoliucinės trajektorijos yra nesuderinamos skirtingos. Klausimas, susijęs su tuo, ar J yra atgimęs ir jei taip, kokia forma, ji išlieka griežtų ginčų, kurie yra viena iš svarbiausių šios knygos temų.